Генетическая генеалогия. Определение гаплогруппы человека
В настоящее время появляются новые виды генетических исследований. Одним из последних направлений генетических анализов является генетическая генеалогия или, как ее еще называют, ДНК-генеалогия. Данный вид исследования применяется наряду с традиционными методами генеалогических исследований. Обычно генеалогия строится на архивных и прочих документальных свидетельствах. В случаях, когда бумажного следа просто нет, либо имеющиеся документы содержат крайне противоречивые сведения, принадлежность к одному генеалогическому древу можно установить посредством исследований ДНК. К примеру, при исследовании особенностей Y-хромосомы двух мужчин, можно установить, имеют ли два данных человека общего предка по мужской линии.
В основе генетической генеалогии лежит определение гаплогруппы человека, к которой относится человек, генетический материал которого представлен для осуществления экспертизы.
Гаплогруппа – большая общность людей, которые имеют одного предка. Понятие гаплогруппы базируется на выделении определенного гаплотипа – последовательности аллелей, содержащихся в одном участке (локусе) хромосомы. Некоторые гены человека (как и любых диплоидных организмов) состоят из двух гаплотипов, один из которых находится в хромосоме, полученной от матери, а второй, соответственно, в хромосоме, полученной от отца. Начало каждой из ныне существующих гаплогрупп положил предок, у которого в обоих имеющихся гаплотипах присутствовала одна и та же мутация, которая называется однонуклеотидным полиморфизмом. При такой мутации последовательность ДНК в гомологичных участках гомологичных хромосом отличается ровно на один нуклеотид. Удивительно, но с течением большого количества времени следы данной мутации практически не исчезли и до сих пор прекрасно обнаруживаются при анализе ДНК. Ученые считают, что естественный отбор практически не действует на организмы, имеющие обозначенную мутацию, что и позволяет определять общего предка, полагаясь на исследование принадлежности человека к той или иной гаплогруппе.
Гаплогруппы определяются по Y-хромосоме, по митохондриальной ДНК, а также существуют ГКГ-гаплогруппы, выделяемые согласно главному комплексу гистосовместимости – большой группе генов позвоночных, имеющей большое значение в формировании иммунной системы. В настоящее время генетическое сообщество разработало общую классификацию и номенклатуру гаплогрупп по Y-хромосоме. Ученые выделили 18 базовых мутационных блоков в хромосоме, которые получили название кладов. Каждый клад обозначается латинской буквой от A до R. В каждом кладе, соответственно, выделяются гаплогруппы, в названии которых содержится латинская буква, обозначающая данный клад, и дополнительные буквы и цифры. Митохондриальные гаплогруппы (мт-ДНК гаплогруппы) также были классифицированы. Каждая группа носит свое название, состоящее из латинских букв и цифр.
Для мужчин возможно проведение исследований по принадлежности к мт-ДНК гаплогруппе или к Y-ДНК гаплогруппе. Для женщин возможно установить принадлежность к гаплогруппе, определяемой путем анализа митохондриальной ДНК. Следует отметить, что из-за более компактного размера митохондриальной ДНК (по сравнению с ДНК Y-хромосомы) отслеживать дрейф некоторых мутаций с ее помощью несколько сложнее. Считается, что мт-ДНК галогруппы сформировались во время ледникового периода. Они связаны с этническим происхождением на глобальном, континентальном уровне. Ученые связывают это с более частым покиданием женщинами своего рода – при замужестве.
Все европейские митохондриальные гаплогруппы взяли начало в надгруппе (кладе) N. Считается, что это была одна из двух первых миграционных волн людей из Африки, имевших место 60-80 тысяч лет назад. Чистая гаплогруппа N на сегодняшний день встречается крайне редко в разных частях Евразии. Распространение гаплогрупп тесно связано с распространением и образованием языков. Так, например, представители общей славянской гаплогруппы говорят на сходных языках.
Наши заключения отвечают требованиям объективности, всесторонности и полноты исследований, все экспертизы выполняются с использованием современных достижений науки и техники.
Если вы не уверены в правильности выводов заключения сторонней организации, наши эксперты помогут найти ошибки процессуального или методического характера, и дать соответствующее заключение (рецензию).
Порядок производства генетической генеалогии. Определение гаплогруппы человека
Производство генетической генеалогии. Определение гаплогруппы человека осуществляется на основании договора с физическим или юридическим лицом, определения или постановления суда, постановления дознавателя или следователя, налогового инспектора, постановления дознавателя таможни, в рамках государственных закупок.
Перед заключением договора заказчик может получить предварительную консультацию на которой эксперт объяснит основные особенности, уточнит цели заказчика, сформулирует вопросы перед экспертом на которые предстоит ответить в ходе производства экспертизы и разъяснит возможные результаты экспертизы.
Определение гаплогруппы человека – сравнительно молодой вид генетических исследований, однако с каждый годом его популярность растет, так как он позволяет разобраться во многих запутанных жизненных ситуациях. Чаще всего, к определению гаплогруппы человека прибегают в следующих случаях:
Для определения гаплогруппы человека в его гаплотипе выделяют определенные метки – маркеры, по которым производится сравнение. Самый распространенный способ определения гаплогруппы человека использует 25-тимаркерные гаплотипы. Однако за прошедшие несколько тысяч лет произошло множество мелких мутаций в генотипе человека и 25-тимаркерного гаплотипа может оказаться недостаточно. Поэтому стали выделять гаплотипы, содержащие 37, 45, 67, а то и вовсе 111 маркеров. Чем больше маркеров, тем более точное исследование можно провести, хотя оно будет гораздо более трудоемким и дорогостоящим.
Чтобы провести исследование по определению гаплогруппы человека необходимо собрать его ДНК, что выполняется точно таким же способом, как и для любого другого генетического анализа. Наиболее распространенным является соскоб с внутренней поверхности щеки, производимый специальной ватной палочкой. После сбора генетического материала, его необходимо передать в лабораторию, осуществляющую процедуру определения гаплогруппы человека. Причем образец ДНК можно даже переслать по почте без ущерба для генетического материала. Это обстоятельство делает доступными генетические анализы даже для жителей маленьких и отдаленных населенных пунктов.
Необходимая ДНК выделяется из того же буккального эпителия и путем нескольких последовательных секвенирований (выделения нуклеотидной последовательности) определяется необходимый гаплотип.
Анализ ДНК на этническое происхождение рода по линии отца и матери
Вас интересуют такие вопросы, как:
Выбирая этот тест, будьте уверены:
Результат генетического теста происхождения рода выдаётся в формате Книги с картами и иллюстрациями, где описаны:
«Теоретическая информация»:
— Что такое ДНК генеалогия?
— Гаплогруппы, подгруппы и клады, номенклатура гаплогрупп, происхождение гаплогрупп
— Что можно узнать при помощи ДНК генеалогии
— Как получаются генетические данные
— ДНК маркеры и для чего они нужны
— Анализ мтДНК и анализ Y-хромосомы
«Детальные результаты»:
— Информация о полученной гаплогруппе
— Время и место происхождения
— Распространение в историческом контексте
— Распространение сейчас
— Известные носители данной гаплогруппы
— Рекомендованная литература и ссылки на самые известные ресурсы, где есть еще больше информации о полученной гаплогруппе.
Изучение генетического кода человека в 80-х годах ХХ века привело к появлению новой науки — палеогенетики или молекулярной палеонтологии. Оказалось, что в генотипе (совокупность всех генов организма) зашифрована эволюционная история человека.Гены предстали в виде надежного источника информации, благодаря которому можно отследить историю происхождения ныне живущих, сравнив их ДНК с ДНК людей, родившихся многие тысячи лет назад. Так появилось понятие гаплогрупп — групп схожих типов генов, доставшихся в наследство от одного предка. Генетической генеалогии интересны Y-ДНК (Y-хромосома, позволяющая определить предка по мужской линии, так как эта хромосома имеется только у мужчин. Этого прародителя еще называют «молекулярно-биологический Адам».) и мт-ДНК, она же митохондриальная (определяет предка по женской линии, ее прозвали «митохондриальная Ева»).
Анализ ДНК на гаплогруппу
Статья опубликована: 2018-08-14
Рейтинг: 5 из 5
ДНК человека насчитывает сорок шесть хромосом, из которых одна половина наследуется от отца, а вторая — от матери. Из хромосомного набора, полученного от отца, только в одной Y хромосоме находятся нуклеотиды, которые передаются потомкам в течение нескольких тысяч лет без изменений. Наборы неизменных нуклеотидов получили название — гаплогруппы ДНК, в которые объединена вся популяция людей Земли.
Люди одной гаплогруппы имеют общего прародителя в далеком прошлом, а у мужской половины одной народности она является одинаковой. Можно сказать, что генетическая группа является маркером определенного народа.
Что такое тест на гаплогруппу
Сейчас все большую популярность приобретает анализ на гаплогруппу, результаты которого позволяют установить историю происхождения и миграции рода, самых дальних прародителей. В современной генетике гаплогруппы имеют буквенные обозначения от А – самой древней, которая сформировалась 200 тысяч лет назад, до R – самой молодой, возраст которой составляет 25 тысяч лет.
На сегодняшний день практически нет людей, которые бы 100% принадлежали к одной группе. Как правило, присутствует смешение нескольких народностей. В качестве примера можно привести следующие характеристики генетических групп:
Точное соотношение каждой группы можно узнать, если сдать анализ на гаплогруппу в специализированной лаборатории.
Как узнать свою гаплогруппу
Чтобы определить, к какой этнической или расовой группе принадлежит человек, необходимо сдать анализ крови на гаплогруппу или образец буккального эпителия, после чего проводят лабораторное исследование биоматериала. В гаплотипе исследуемого человека выделяют специальные маркеры, по которым и проводится сопоставление.
Сейчас определение гаплогруппы по ДНК проводится следующими способами:
Для мужского пола исследования проводятся по мтДНК и Y хромосоме, для женского – по митохондриальной ДНК. Самый распространенный способ проведения исследований предполагает использование гаплотипа с 25 маркерами. Поскольку за длительное время генотип человека претерпел различные мутации, на сегодняшний день стали использовать большее количество маркеров, число которых может достигать 111. Чем большее количество маркеров используется в процессе исследования, тем более точный результат можно получить.
Как проходит анализ ДНК на гаплогруппу
Чтобы сделать генетический анализ гаплогруппы, следует обратиться в лабораторию, которая специализируется на проведении ДНК исследований. Процедура проходит следующим образом:
После того, как проведен анализ на гаплогруппу, составляется официальное заключение, которое оформляется на фирменном бланке. В нем указывается процентное соотношение каждой группы, указываются миграционные направления дальних предков, происхождение гаплогруппы, какие племена и народы жили на этих землях, а также кто из известных людей имеет такую же гаплогруппу.
Где сдать тест на гаплогруппу в Москве
Если Вы хотите пройти анализ ДНК на генеалогию гаплогруппы, обращайтесь в ДНК лабораторию ДТЛ, которая является лидером в области генетических исследований. Здесь применяются передовые технологии ДНК-исследований, используется современное оборудование «Applied Biosystems», которое признано самым эффективным в мире. С помощью этой аппаратуры проходит одновременное тестирование образцов ДНК, что позволяет в течение короткого промежутка времени получить точный результат.
Мы стремимся сделать наши услуги удобными и доступными для всех желающих. Поэтому сдать образцы биоматериала – клеток буккального эпителия, можно как у нас в лаборатории, так и дома, с использованием специального бесплатного набора. Как его получить и правильно сделать соскоб, расскажут наши консультанты.
Основными преимуществами наших услуг является:
Заказать определение гаплогруппы в Москве можно на нашем сайте. Более детальную информацию можно получить у наших консультантов в телефонном режиме.
Генетика происхождения. Гаплогруппы
Происхождение — один из самых интересных разделов генетического теста Атлас. Из него можно узнать свою гаплогруппу, популяционный состав и насколько ты неандерталец. В серии статей мы решили рассказать о генетике происхождения подробнее: как эту область исследуют, какие данные мы можем получить и что они означают. В первой статье рассказываем про гаплогруппы.
Модель Земли с миграцией предков из личного кабинета Атласа
Что такое гаплогруппы
Перед тем как погружаться в определение гаплогрупп, давайте сначала вспомним, как дети наследуют генетический материал родителей.
Всего в нашем геноме 23 пары хромосом: по одной от каждого родителя. В случае девочек 23-я пара состоит из двух Х хромосом, а в случае мальчиков — из Х и Y хромосом. Ещё каждый ребенок наследует от матери митохондриальную ДНК — ту, что находится не в ядре, а в митохондриях.
Каждый человек имеет уникальный генетическую информацию, которая получается в том числе из-за рекомбинации генов родителей. При этом Y-хромосома и мт-ДНК остаются неизменными пока не произойдет какое-либо случайное изменение в гене, например однонуклеотидный полиморфизм.
Такое изменение будет передаваться по наследству, и мы сможем определить группу людей, которая произошла от одного предка. Такие группы называются гаплогруппами. А группа аллелей, которая наследуется в неизменном виде — гаплотипом.
Аллели — различные формы одного и того же гена, которые находятся в одном и том же участке парных хромосом. Когда на обеих хромосомах одинаковые аллели, тогда ген называют гомозиготным, а когда разные — гетерозиготным.
Разные аллели могут приводить к различиям в фенотипе — проявлениям признака. Комбинации аллелей называются генотипом, а те комбинации, которые передаются без изменений — гаплотипом.
Около 95% кофеина в организме метаболизирует в печени цитохром CYP1A2. Вариант гена CYP1A2 rs762551 изменяет активность цитохрома, в результате чего кофеин оказывает более длительное действие на организм и приводит к неприятным эффектам. У людей с генотипом А/С медленный метаболизм кофеина. Медленный метаболизм — и есть фенотип, то есть проявление генетического признака.
Все мужчины и женщины на земле имеют общих предков — Y-хромосомного Адама и митохондриальную Еву. Они не были первыми и единственными людьми на Земле, просто мт-ДНК и Y-хромосомы других людей, живших 150-100 тысяч лет назад, не дошли до наших дней. Полиморфизмы Y-хромосомного Адама и митохондриальной Евы есть у каждого человека на планете.
Схема миграции Y-хромосомных гаплогрупп
Остальные изменения в Y-хромосоме и мт-ДНК не настолько распространены, но все равно встречаются у большого количества людей. Одна гаплогруппа может определяться у десятков тысяч людей, вторая — у тысяч, а третья лишь у сотни. Причина такой неравномерности — дрейф генов. Дело в том, что из-за случайных событий меняется частота аллелей в популяции. Группа людей, которая прошла через бутылочное горлышко, оставит после себя меньше определенных изменений, чем остальные группы.
Бутылочное горлышко — сокращение генетического разнообразия популяции и из-за какого-либо события. Это может привести либо к полному вымиранию популяции, либо к восстановлению, но с меньшим разнообразием аллелей.
Пример бутылочного горлышка — резкое снижение генетического разнообразия Y-хромосомы, которое произошло семь тысяч лет назад. Ученые Стенфордского Университета США объяснили, что причиной этого может быть борьба между патрилинейными кланами. Некоторые из них полностью уничтожались. Мужчины также отказывались переходить в другие кланы, что снижало генетическое разнообразие.
Все гаплогруппы, кроме корневой, имеют родительскую гаплогруппу и одну или несколько дочерних гаплогрупп. Например, R1b1 — «дочка» гаплогруппы R1b. Первая буква в названии означает основную группу, в то время как остальные буквы и цифры используются для более поздних изменений в ДНК.
Дерево гаплогрупп с вертикальной временной шкалой
В генетическом тесте «Атлас» мы исследуем все основные гаплогруппы и их субклады — ветви второго уровня. Если мы обнаружим полиморфизмы более специфичных субкладов — третьего, четвертого уровня и ниже — они тоже попадут в отчет. Из открытых данных мы взяли информацию о гаплогруппах известных личностей. Например, если тест покажет, что у вас одна гаплогруппа с Томом Хэнксом или Николаем Коперником, значит, у вас с ним есть общий древний предок.
В России самые распространенные Y-хромосомные гаплогруппы — R1a, N, I2, а митохондриальные — H, U5, J.
Гаплогруппы могут быть связаны со здоровьем человека, что довольно логично, ведь некоторые популяции более подвержены определенным заболеваниям, чем остальные. Однако исследований на эту тему было немного.
Схема миграции митохондриальных гаплорупп
В одной работе выяснилось, что ишемическая кардиомиопатия чаще диагностируется у людей с материнской гаплогруппой H, чем у остальных. А гаплогруппа J, наоборот, чаще встречалась у здоровых людей. Стоит отметить, что группы в исследовании были небольшими, около 400 человек в каждой.
Британское исследование показало, что ишемическая болезнь сердца чаще встречалась у носителей отцовской гаплогруппы I. Это исследование было крупнее, в нем использовались данные 3200 британцев.
Как определяют гаплогруппы
Структура данных и алгоритм подсчета одинаковый и для материнской, и для отцовской гаплогруппы. Разница лишь в том, что для первой подсчет проводится по мт-ДНК, а для второй — по Y-хромосоме и мт-ДНК.
Существует много разных инструментов для определения гаплогрупп по полиморфизмам. Разные инструменты для вычисления отцовской гаплогруппы можно найти здесь, а для материнской — здесь. В некоторых случаях для определения отцовской гаплогруппы могут использоваться данные о коротких тандемных повторах (STR), а не о полиморфизмах.
Короткие тандемные повторы или микросателлиты — повторяющиеся фрагменты ДНК длиной от 1 до 6 пар оснований. Чаще всего исследование микросателлитов используется в криминалистике. Найти человека по количеству повторов определенного участка намного легче, чем по однонуклеотидному полиморфизму. К тому же для определения микросателлитов не нужен анализ всей ДНК — достаточно посмотреть определенный участок одной хромосомы.
Чтобы определить гаплогруппу по микросателлитам, подбирается подходящая комбинация разных коротких тандемных повторов. Когда они совпадают со значениями, которые соответствуют той или иной гаплогруппе, пользователь получает конечный результат.
Анализ по полиморфизмам отличается. Каждый узел дерева гаплогрупп представляет собой набор определенных полиморфизмов. Из открытых источников мы берем соответствующее дерево в зависимости от того, вычисляется ли отцовская или материнская гаплогруппа, и присваиваем вес каждому полиморфизму. Чем реже вариант встречается в дереве, тем больше его вес.
Путь в дереве полиморфизмов от корня до каждой гаплогруппы должен соответствовать максимальному итоговому весу. Таким образом мы получаем дерево пользователя, где результатом является нижняя гаплогруппа в дереве. В личном кабинете пользователь также увидит родительские гаплогруппы, которые встречались ранее.
Как это выглядит в личном кабинете
В разделе География пользователь видит свои гаплогруппы и описание к ним. У мужчин отображается и материнская, и отцовская гаплогруппа, у женщин — только материнская.
Полиморфизмы в геноме накапливаются с относительно постоянной скоростью. Достаточно поделить количество изменений на скорость, чтобы узнать примерное время появления мутации. В открытом доступе также есть данные о миграции материнских и отцовских гаплогрупп.
Мы решили объединить всё это с результатами пользователя и визуализировать миграцию его предков на модели Земли. Посмотреть и покрутить ее можно здесь. В одной из следующих статей мы подробно расскажем, как собирали модель и с какими проблемами столкнулись.
Из открытых данных мы взяли информацию о гаплогруппах известных личностей. Например, если тест покажет, что у вас одна гаплогруппа с Томом Хэнксом или Николаем Коперником, значит, у вас с ним есть общий древний предок.
В следующей статье Атлас расскажет, почему генетики используют понятие популяция, чем оно отличается от национальности и как определяется популяционный состав человека по вариантам генов.
ДНК тест на этническое происхождение в Москве
Наверняка Вы задавались вопросом «Кто же я по национальности?» Причиной этому может быть чистое любопытство или это может быть вынужденный шаг для целей миграции, получения наследства и т.д. Наша лаборатория проводит все виды ДНК исследований, включая и ДНК тест на этническое происхождение. Этот генеалогический ДНК анализ поможет узнать о Вашем происхождении, где зародились Ваши предки и какие пути миграции им пришлось преодолеть. Вы получите 100%-ный результат и узнаете происхождение своего рода. Это самый технологичный и точный анализ!
Обращаясь в «Ralzo», Вы напрямую обращаетесь в ДНК лабораторию Москвы и получаете следующие преимущества:
В каких ситуациях делают этнический ДНК тест
Опишем лишь некоторые причины, почему стоит провести ДНК тест на этническую принадлежность:
Лаборатория работает со всеми судами Москвы и России!
Как сдать образцы для ДНК теста на этническую принадлежность
Для теста ДНК нужны образцы. За стандарт принимается во всем мире ротовой соскоб буккального эпителия, который расположен с внутренней стороны щеки. Этот образец иногда называют «анализ по слюне», но по факту исследуются клетки, оставшиеся в ватной головке, в то время как лишняя вода испаряется из образца. Этот образец называется стандартным. Такой образец можно сдать, приехав к нам лично, или в домашних условиях (смотрите инструкцию). Если образец был взят дома и хранился несколько недель и даже месяцев, наша лаборатория может провести тест даже по такому образцу.
Все остальные образцы являются НЕстандартными.
К ним относятся, например: кровь жидкая и сухая, волосы, предметы личной гигиены, окурки, ногти, биологические жидкости и т.д., полный перечень смотрите тут.
Точность анализа на отцовство для стандартных и НЕстандартных образцов одинаковая!
Многое зависит от вида образца и условий его хранения, поэтому мы рекомендуем обратиться за консультацией к специалисту лаборатории по телефону +7 (495) 658-29-58.
Где сдать образцы для ДНК анализа на этническую принадлежность в Москве
Существуют разные способы сдать образцы ДНК на отцовство и родство:
Получить бесплатную консультацию специалиста Москвы
Как оплатить генеалогический ДНК тест и получить результат
Для удобства у нас существуют разные способы оплаты ДНК теста:
Для удобства у нас существуют разные способы получения результатов ДНК тестирования:
Каждой заявке соответствует уникальный 16-ти значный номер.
Это номер, который будет известен только лаборатории и заказчику.
Данные находятся на закрытых локальных серверах, что дает абсолютную сохранность всех данных.
ДНК тест на этническую принадлежность в Москве
Установление национальности по ДНК проводится в нашей лаборатории, благодаря чему ДНК тест на этническую принадлежность в Москве и других городах России мы делаем по цене 4900 руб. Данный ДНК анализ абсолютно точно установит Вашу гаплогруппу и Ваше генетическое происхождение, покажет, какие этносы присутствуют в Вашей родословной и в каком соотношении.
Мы специализируемся на ДНК анализах на этническую принадлежность. У нас есть полное понимание методов и способов проведения ДНК тестов, особенностей проведения полимеразной цепной реакции. При консультации со специалистами лаборатории, Вы можете быть уверены, что для Вашей конкретной ситуации будет подобран наилучший вариант ДНК теста. Вам не придется переплачивать лишние деньги или собирать образцы ДНК от дополнительных участников, в тех случаях, когда это не нужно.
